Важно отметить, что хромовый ангидрид очень ядовит, как, впрочем, и остальные соединения шестивалентного хрома. Хранят трехокись хрома в стеклянной либо в пластиковой герметичной посуде, исключая всякий контакт с другими органическими веществами. Работа с хромовым ангидридом требует применения спецодежды и средств индивидуальной защиты.
При соприкосновении с кожей может вызвать сильное раздражение, различные типы дерматитов и спровоцировать рак кожи. В любом случае после воздействия на кожу оставляет неисчезающие пятна темного цвета. Вдыхание паров хромового ангидрида опасно даже в малых дозах. При попадании на бумагу может вызвать резкое окисление с воспламенением, при контакте со спиртом образуется пламя, можно спровоцировать взрыв.
